為了提高產品質量、安全和衛生，制藥、食品制造、醫療器械制造、生物化學和細菌培養等。需要專門的無菌生產空間——潔凈室。在醫藥生產中，微粒和微生物是醫藥生產潔凈室環境控制的主要對象。潔凈室潔凈度控制，塵埃粒子數控制。潔凈室系統在控制潔凈室塵埃粒子數量方面起著非常重要的作用。當注射生產的空氣潔凈度要求為100時，采用垂直和水平單向流型；當空氣潔凈度等級為10000或100000時，采用非單向流動，及時帶走生產過程中產生的粉塵和灰塵，保持無塵車間環境的清潔。
嚴格控制潔凈室與相鄰房間的壓差也是保證生產間空氣潔凈度的重要環節。在不同級別的潔凈室以及潔凈區與非潔凈區之間，送風、回風和排風系統流程的開啟和關閉應聯鎖并按順序操作，以避免空氣回流，減少低層粉塵對潔凈室環境的污染。每次生產前和一定生產周期后，都要在靜態條件下檢測潔凈室中的塵埃粒子數，以評估和掌握潔凈室中塵埃粒子的含量。
潔凈室分為生物潔凈室和非生物潔凈室。生物潔凈室的空氣凈化系統必須連續運行；非生物潔凈室的空氣凈化系統應在使用前提前4小時啟動。用于檢測塵埃粒子的塵埃粒子計數器，在環境衛生清潔后，應緩沖0.5 ~ 1小時。為了避免人為污染，靜態測試時潔凈室只有兩個人。在注射劑生產過程中，應對關鍵控制點進行動態監控。微生物含量的控制。潔凈室環境中微生物含量的控制仍然依賴于良好的空氣凈化系統設施。
減少操作人員對無菌環境的影響。是人類無菌環境的最大污染源。因此，潔凈區和手術室工作的人數、操作動作的范圍以及工作服的款式、質地和穿著對微粒和細菌的含量有明顯的影響。保持良好的無菌環境需要以下兩個方面：嚴格控制潔凈工作服的樣式、質地、穿著、清洗和滅菌周期；嚴格控制操作人員數量，約束其行為，保證潔凈區的凈化水平。
